O CISA colabora ao nível técnico e cientifico com várias instituições nacionais e internacionais. Estas colaborações, específicas a cada estudo ou intervenção, permitem aprofundar o carácter técnico e cientifico destes, bem como de reforçar capacidade de formação do CISA.

O CISA conta também com apoios financeiros para estudos ou actividades através do mecenato ou de subsídios resultantes de candidaturas a propostas de projectos ou a apoios.